Milhões de anos atrás, uma nave de uma raça avançada humanóide alienígena chega à Terra. Um dos aliens consome um líquido escuro, fazendo com que o seu corpo a se desintegrar e cair em uma cachoeira próxima. Vemos seu DNA quebrar e recombinar, semeando a Terra com os blocos de construção da vida. No ano de 2089, na Ilha de Skye ao largo da costa da Escócia, arqueólogo casal Elizabeth Shaw (Noomi Rapace) e seu namorado Charlie Holloway (Logan Marshall) descobrir um mapa estelar em uma caverna que eles registram, entre os restos de várias culturas antigas, caso contrário não conectadas. Eles interpretam isso como um convite a partir de precursores da humanidade. Peter Weyland (Guy Pearce), o fundador idosos e CEO da Weyland Corporation, fundos da criação do espaço profundo navio de pesquisa científica chamado USS Prometheus seguir o mapa para a lua distante de LV-223 anos-luz da Terra. A A tripulação do navio viaja em hibernação estase na velocidade da luz, enquanto o android David (Michael Fassbender) fica acordado no controle do piloto para monitorar toda a sua viagem. Em 2093, o navio chega na órbita em torno de LV-223.
Após ser despertado do estado de hibernação, a equipe são informados da sua missão para encontrar os aliens antigos, chamados de "engenheiros" que podem ser os seres humanos originais.
